Tentara Belanda menyerah kepada tentara Jepang. Orang-orang Jepang telah tinggal di Surabaya sejak zaman kolonial Belanda. Di antara mereka banyak yang membuka toko, misalnya toko Chioda yang bersebelahan dengan toko besar milik orang Inggris, Whiteway. Namun, mereka tiba-tiba meninggalkan tokonya. Mencurigakan. Ternyata, pemerintah Jepang telah memberi tahu warganya bahwa perang dengan Belanda tidak terhindarkan. Mereka pun pulang secara bertahap dengan kapal-kapal Jepang yang rutin berlayar ke Hindia Belanda. “Toko Jepang terbengkalai atau dibeli pedagang Tionghoa. Ada sebagian diklaim pemerintah militer Jepang. Tetapi, banyak sumber menyebutkan terbengkalai,” kata Meta Sekar Puji Astuti, Ketua Departemen Sastra Jepang Universitas Hasanuddin Makassar, kepada Historia beberapa waktu lalu. Sejarawan Frank Palmos dalam Surabaya 1945 Sakral Tanahku menyebut bahwa perginya mereka bagian dari rencana panjang Jepang yang terpantau oleh badan intelijen Hindia Belanda. Seperti dijabarkan dalam laporan resmi tentang kegiatan mata-mata Jepang, Ten Years of Japanese Burrowing in the Netherlands East Indies, yang diterbitkan oleh Netherlands East Indies Service pada 1942. “Dokumen ini melaporkan secara detail siasat Jepang memperkuat jaringan spionase beberapa tahun sebelum menyerang,” tulis Palmos. Palmos melanjutkan, pihak intelijen pemerintah kolonial Belanda melampirkan bukti bahwa warga sipil Jepang yang menghilang sebelum pasukan Jepang mendarat, datang kembali dalam seragam militer bersama pasukan pendudukan. Ide Anak Agung Gde Agung, menteri luar negeri era Sukarno, mengungkapkan bahwa mata-mata Jepang pada masa kolonial Belanda sering bepergian dari kota ke kota, dari pelabuhan ke pelabuhan, untuk menghimpun informasi, tanpa menimbulkan kecurigaan karena menyamar sebagai pebisnis. “Gerak-gerik mata-mata Jepang menjadi gamblang maksudnya ketika mereka kembali sebagai bagian dari pasukan pendudukan,” tulis Palmos. Yang jelas, informasi yang mereka kumpulkan telah dilaporkan dan dimanfaatkan dengan baik oleh militer Jepang dalam menentukan lokasi pendaratan pasukan infanteri mereka. Bahkan, menurut Palmos, berkat pengetahuan mendalam mata-mata Jepang soal industri minyak bumi di Hindia Belanda, sabotase Belanda pada instalasi minyak bumi menjelang kekalahan dengan mudah dapat diperbaiki oleh Jepang. Pada 8 Desember 1941 melalui siaran radio diumumkan perang antara Jepang dan Belanda. Pada 9 Januari 1942, Belanda menangkap sekira orang Jepang, hampir semuanya laki-laki, yang masih berada di Hindia Belanda dan mengasingkannya ke Australia. Jepang mengalahkan Belanda dengan mudah dan mengambil alih pendudukan atas Indonesia pada Maret 1942. “Sejarah toko Jepang ini bisa dikatakan terhapus dari Hindia Belanda yang kemudian digantikan dengan sejarah pendudukan Jepang di Hindia Belanda,” kata Meta. Meskipun sebagian besar pemilik dan pengelola toko Jepang kembali ke Jepang, namun sekira 707 orang Jepang kembali ke Indonesia. Menurut Meta, kembalinya mereka sebagai pegawai pemerintah militer Jepang menguatkan dugaan bahwa semua mantan pemilik dan pengelola toko Jepang di Hindia Belanda adalah mata-mata. “Mereka datang bukan untuk berdagang, tetapi bekerja untuk pemerintah pendudukan,” kata Meta yang menulis buku Apakah Mereka Mata-mata? Orang-orang Jepang di Indonesia 1868–1942. Mengapa Belanda tidak siap menghadapi Jepang padahal rajin mengumpulkan data tentang kegiatan mata-mata Jepang? Menurut Palmos, salah satu sebab Belanda kedodoran adalah keyakinan mereka bahwa pangkalan militer Inggris di Singapura tidak mungkin dikalahkan Jepang. Jika Singapura tidak bisa runtuh, Jepang pun tidak bisa masuk ke Hindia Belanda. Ketika Inggris di Singapura benar-benar takluk, pemerintah Hindia Belanda panik. Belanda dengan mudah ditaklukkan oleh Jepang. Rakyat Surabaya penasaran bagaimana rupa bangsa penakluk Belanda. Mereka keluar rumah untuk menyaksikan tentara Jepang yang masuk melewati jalan-jalan. Mereka terkejut melihat tentara Jepang yang pendek di atas sepeda, memanggul bedil yang terlihat kebesaran untuk postur mereka. Awalnya kehidupan berjalan seperti biasa. Semuanya berubah dalam waktu singkat. Jepang mengerahkan dengan paksaan semua sumber daya untuk keperluan perang. Meski hanya tiga setengah tahun, pendudukan Jepang telah mengakibatkan penderitaan bagi rakyat Indonesia.